Центр предназначен для теоретического обучения военных специалистов по программам дополнительного профессионального образования и практического переучивания специалистов морской авиации Военно-Морского Флота, обеспечения испытаний перспективных образцов вооружения и военной техники Военно-Морского Флота, подготовки младших военных специалистов, организации и обеспечения подготовки национальных военных кадров и технического персонала иностранных государств.

В настоящее время 859 ЦБП и ПЛС (МА ВМФ) представляет из себя военную организацию осуществляющую образовательную деятельность и включающую в себя 8 основных и 22 подразделения обеспечения.